Определение штаммов коронавируса SARS-CoV-2

08.04.2021

Впервые в Украине в лаборатории Diagen проводится определение особо опасных штаммов коронавируса (британского и других).

На данный момент в мире существует более 100 разновидностей SARS-CoV-2, многие из которых отличаются по своей скорости распространения, заразности и тяжести протекания заболевания. CDC выделяет всего 5 штаммов вируса, которые на данный момент имеют доказанную повышенную скорость передачи, приводят к более тяжелому течению заболевания или способны ускользать от иммунного ответа. Наиболее изученными из них являются три:

  • Британский вариант
  • Южноафриканский вариант
  • Бразильский вариант

Британский вариант

Штамм B.1.1.7 или «британский штамм» впервые обнаружен в Великобритании в конце 2020 года, хотя происхождение этого штамма все еще точно неизвестно. Данная разновидность вируса отличается от исходного вируса на 23 мутации, из которых 17 могут приводить к серьезным изменениям в свойствах вируса.

Характерные черты британского штамма

  1. На 50-74% повышена трансмиссивность (способность вируса к передаче между людьми)
  2. Повышена тяжесть течения заболевания (в особенности вероятность госпитализации и смерти)
  3. Минимальный ответ на нейтрализующие моноклональные антитела
  4. Минимальное ответ на нейтрализующее действие сыворотки выздоравливающих и вакцинированных пациентов
  5. Может не определяться некоторыми ПЦР-тестами, которые направлены на S-ген

Южноафриканский вариант

Штамм SARS-CoV-2 B.1.351 обнаружен в ЮАР, но активно распространяется по всему миру, и с 28 декабря 2020 года уже найден в Европе. В этом штамме насчитывают 21 мутацию, включая 9 аминокислотных замен в чрезвычайно важном S-белке, которые непосредственно участвуют в проникновении вируса в клетки организма человека. От обычных вариантов вируса отличается более быстрой скоростью передачи между людьми, и менее восприимчив к действию защитных антител.

Характерные черты южноафриканского штамма

  1. В среднем на 50% повышена трансмиссивность (способность вируса к передаче между людьми)
  2. Снижена эффективность нейтрализации вируса моноклональными антителами
  3. Снижена эффективность ответа на нейтрализующее действие сыворотки выздоравливающих и вакцинированных пациентов

Бразильский вариант

Штамм P.1 найден в Японии у туристов из Бразилии, и поэтому считается бразильским. В данное время активно обнаруживается во многих странах мира, и с 12 января 2021 года уже найден в Европе. Для этого штамма характерными являются 10 мутаций в гене S-белка, которые могут влиять на характеристики SARS-CoV-2.

Характерные черты бразильского штамма

  1. Снижена эффективность нейтрализации вируса моноклональными антителами
  2. Снижена эффективность ответа на нейтрализующее действие сыворотки
  3. Повышенная скорость передачи между людьми, по данным некоторых исследований на 127-178%
Британский штаммЮжно - африканский штаммБразильский штамм
B.1.1.7B.1.351P.1
Повышенная контагиозность (заразность)+++
Более тяжелое течение заболевания+--
Потенциально менее восприимчив к действию вакцин-++
Выявлен в европейских странах+++

Тест в лаборатории Diagen позволяет выявить мутации вируса SARS-CoV-2 методом ПЦР, определяющие его принадлежность к трем особо опасным вариантам коронавируса: британскому, южноафриканскому и бразильскому штаммам.

Где Вы можете сдать тест?

Во всех отделениях Diagen, а также заказать вызов медицинской сестры на дом или в офис.

Для сдачи исследований на коронавирус (ПЦР, антитела, антиген) необходимо предоставить документы, подтверждающие личность. Для выдачи результата на английском языке необходима копия или фото загранпаспорта.

Нужно записываться заранее на тестирование?

Предварительно записываться на прохождение теста не требуется.

Когда можно получить результаты?

ПЦР-тестирование с определением штаммов коронавируса выполняется за 24 часа.
Бланк с результатом ПЦР-теста на COVID-19 содержит QR-код с ссылкой на результат теста на официальный сайт лаборатории Diagen.

Какая цена?

1 250 грн.

Особенности влияния эффекта вакцинации при различных штаммах вируса

Эффективность вакцины COVID-19 против новых штаммов

Оригинальный вирусБританский штаммЮжно - африканский штаммБразильский штамм
B.1.1.7B.1.351P.1
Pfizer-BioNTech95%Такая же эффективностьПониженный уровень антителТакая же эффективность
Moderna94%Такая же эффективностьПониженный уровень антителТребуется больше данных
J&J72% (тестирование в США)Такая же эффективностьПониженный уровень антител (тестирование в Южной Африке)Пониженный уровень антител (тестирование в Латинской Америке)
AstraZeneca60-90%Такая же эффективностьПониженная эффективностьТакая же эффективность
Sinovac50%Такая же эффективностьПониженный уровень антителПониженный уровень антител

Влияние эффекта вакцинации различными вакцинами при последующем заражении разными штаммами

Вакцина (компания)Существовавшие ранее вариантыЭффективность нейтрализации (по анализу вирусных бляшек)Эффективность в случаях с вариантом 501Y.V2)
Объём образцовЭффективность предотвращения клинического COVID-19Эффективность предотвращения острого COVID-19Британский штаммБразильский штаммЮжно- африканский штамм501Y.V2 Южноафриканский штамм
Кол-во% (кол-во случаев: вакцина vs плацебо)%
Ad26.COV2.S (Johnson & Johnson)43 78366 (н/д)85 (н/д)н/дн/дн/д57*, 85**
BNT162b2 (Pfizer)34 92296 (8 vs 162)90 (1 vs 9)Уменьшение в 2 р.Уменьшение в 6.7 р.Уменьшение в ≤6.5 р.н/д
mRNA-1273 (Moderna)28 20794 (11 vs 185)100 (0 vs 30)Уменьшение в 1.8 р.Уменьшение в 4.5 р.Уменьшение в ≤8.6 р.н/д
Спутник V (ФГБУ «НИЦЭМ им. Гамалеи)19 86692 (16 vs 62)100 (0 vs 20)н/дн/дн/дн/д
AZD1222 (AstraZeneca)17 1777 (84 vs 248)100 (0 vs 3)н/дн/дУменьшение в ≤86 р. до полного исчезновения имунного ответа22***
NVX-CoV237315 00089 (6 vs 56)100 (0 vs 1)Уменьшение в 1.8 р.н/д49***
CoronaVac (Sinovac)
Бразилия
Турция
12 396
7 371
51 (н/д)
91 (3 vs 26)
100 (н/д)
н/д
н/д
н/д
н/д
н/д
н/д
BBIBP-CorV (Sinopharm)н/д79 (н/д)н/дн/дн/дУменьшение в 1.6 р.н/д

* Эффективность вакцины, сравнительно с плацебо, против умеренного COVID-19
** Эффективность вакцины, сравнительно с плацебо, против тяжёлого COVID-19 со случаями госпитализации
*** Эффективность вакцины, сравнительно с плацебо, против симптоматического COVID-19

Прим.: Использованы данные до 18.03.2021. Определения лёгкого, умеренного и тяжёлого COVID-19 разнятся между исследованиями. Источник: N. Engl. J Med.2021 Mar 24, 2021. Doi:10/1056/NEJMc2100362

Оформить заявку на исследование

Другие статьи