Визначення штамів коронавірусу SARS-CoV-2

12.04.2021

Вперше в Україні в лабораторії Diagen проводиться визначення особливо небезпечних штамів коронавірусу.

На даний момент в світі існує більше 100 різновидів SARS-CoV-2, багато з яких відрізняються за своєю швидкістю поширення, заразністю та тяжкістю перебігу. CDC виділяє всього 5 штамів вірусу, які на даний момент мають доведену підвищену швидкість передачі, призводять до більш важкого перебігу захворювання або здатні уникати імунної відповіді. Найбільш вивченими з них є три:

  • Британський варіант
  • Південноафриканський варіант
  • Бразильський варіант

Британський варіант

Штам B.1.1.7 або «британський штам» вперше виявлений у Великобританії в кінці 2020 року, хоча походження цього штаму ще точно невідоме. Цей різновид вірусу відрізняється від вихідного вірусу на 23 мутації, з яких 17 можуть призводити до серйозних змін у властивостях вірусу.

Характерні риси британського штаму

  1. На 50-74% підвищена трансмісивність (здатність вірусу до передачі між людьми)
  2. Більш тяжкий перебіг захворювання ( перш за все, ймовірність госпіталізації та смерті)
  3. Мінімальна відповідь на нейтралізуючі моноклональні антитіла
  4. Мінімальна відповідь на нейтралізуючу дію сироватки одужуючих і вакцинованих пацієнтів
  5. Може не визначатися деякими ПЛР-тестами, які спрямовані на S-ген

Південноафриканський ВАРІАНТ

Штам SARS-CoV-2 B.1.351 виявлений в ПАР, але активно поширюється по всьому світу, і з 28 грудня 2020 роки вже знайдений в Європі. У цьому штамі налічують 21 мутацію, включаючи 9 амінокислотних замін в надзвичайно важливому S-білку, які безпосередньо приймає участь в проникненні вірусу в клітини організму людини. Від звичайних варіантів вірусу відрізняється більшою швидкістю передачі між людьми, і меншою чутливістю до дії захисних антитіл.

Характерні риси південноафриканського штаму

  1. В середньому на 50% підвищена трансмісивність (здатність вірусу до передачі між людьми)
  2. Знижена ефективність нейтралізації вірусу моноклональними антитілами
  3. Знижена ефективність нейтралізації вірусу моноклональними антитілами

Бразильський варіант

Штам P.1 знайдений в Японії у туристів з Бразилії, і тому вважається бразильським. В даний час активно виявляється в багатьох країнах світу, і з 12 січня 2021 роки вже знайдений в Європі. Для цього штаму характерними є 10 мутацій в гені S-білку, які можуть впливати на характеристики SARS-CoV-2.

Характерні риси бразильського штаму

  1. Знижена ефективність нейтралізації вірусу моноклональними антитілами
  2. Знижена ефективність відповіді на нейтралізуючу дію сироватки
  3. Підвищена швидкість передачі між людьми, за даними деяких досліджень на 127-178%
Британський штамПівденно-африканський штамБразильский штам
B.1.1.7B.1.351P.1
Підвищена контагіозність (заразність)+++
Більш важкий перебіг захворювання+--
Потенційно менш сприйнятливий до дії вакцин-++
Виявлено в європейських країнах+++

Тест в лабораторії Diagen дозволяє виявити мутації вірусу SARS-CoV-2 методом ПЛР, що визначають його приналежність до трьох особливо небезпечних варіантів коронавірусу: британського, південноафриканського і бразильського штамів.

Де ви можете здати тест?

У всіх відділеннях Diagen, а також замовити виклик медичної сестри додому або в офіс.

Для здачі досліджень на коронавірус (ПЛР, антитіла, антиген) необхідно надати документи, що підтверджують особу. Для видачі результату на англійській мові необхідна копія або фото закордонного паспорта.

Чи потрібно записуватися заздалегідь на тестування?

Попередньо записуватися на проходження тесту не потрібно.

Коли можна отримати результати?

ПЛР-тестування з визначенням штамів коронавірусу виконується за 24 години.
Бланк з результатом ПЛР-тесту на COVID-19 містить QR-код з посиланням на результат тесту на офіційному сайті лабораторії Diagen.

Яка ціна?

1 250 грн.

Особливості впливу вакцинації на різні штами вірусу

Ефективність вакцини COVID-19 проти нових штамів

Оригінальний вірусБританский штамПівденно-африканський штамБразильский штам
B.1.1.7B.1.351P.1
Pfizer-BioNTech95%Така сама ефективністьЗнижений рівень антитілТака сама ефективність
Moderna94%Така сама ефективністьЗнижений рівень антитілПотрібно більше даних
J&J72% (тестування в США)Така сама ефективність Знижений рівень антитіл (тестування в Південній Африці) Знижений рівень антитіл (тестування в Латинській Америці)
AstraZeneca60-90%Така сама ефективністььЗнижена ефективністьТака сама ефективність
Sinovac50%Така сама ефективністьЗнижений рівень антитілЗнижений рівень антитіл

Вплив ефекту вакцинації різними вакцинами при подальшому зараженні різними штамами

Вакцина (компанія)Варіанти, що існували ранішеЕфективність нейтралізації (з аналізу вірусних бляшок)Ефективність у випадках з варіантом 501Y.V2
Об'єм зразків Ефективність запобігання клінічного COVID-19Ефективність запобігання гострого COVID-19Британский штамБразильский штамПівденно- африканський штам501Y.V2 Південноафриканський штам
Кількість% (к-ть випадків: вакцина vs плацебо)%
Ad26.COV2.S (Johnson & Johnson)43 78366 (н/д)85 (н/д)н/дн/дн/д57*, 85**
BNT162b2 (Pfizer)34 92296 (8 vs 162)90 (1 vs 9)Зменшення в 2 р.Зменшення в 6.7 р.Зменшення в ≤6.5 р.н/д
mRNA-1273 (Moderna)28 20794 (11 vs 185)100 (0 vs 30)Зменшення в 1.8 р.Зменшення в 4.5 р.Зменшення в ≤8.6 р.н/д
Супутник V (ФГБУ «НИЦЭМ им. Гамалеи)19 86692 (16 vs 62)100 (0 vs 20)н/дн/дн/дн/д
AZD1222 (AstraZeneca)17 1777 (84 vs 248)100 (0 vs 3)н/дн/дЗменшення в ≤86 р. до повного зникнення імунної відповіді22***
NVX-CoV237315 00089 (6 vs 56)100 (0 vs 1)Зменшення в 1.8 р.н/д49***
CoronaVac (Sinovac)
Бразилія
Туреччина
12 396
7 371
51 (н/д)
91 (3 vs 26)
100 (н/д)
н/д
н/д
н/д
н/д
н/д
н/д
BBIBP-CorV (Sinopharm)н/д79 (н/д)н/дн/дн/дЗменшення в 1.6 р.н/д

** Ефективність вакцини, порівняно з плацебо, проти помірного COVID-19
** Ефективність вакцини, порівняно з плацебо, проти важкого COVID-19 з госпіталізацією
*** Ефективність вакцини, порівняно з плацебо, проти симптоматичного COVID-19

Прим.: Використано дані до 18.03.2021. Критерії визначення легкого, помірного та тяжкого перебігу COVID-19 відрізняються між дослідженнями Джерело: N. Engl. J Med.2021 Mar 24, 2021. Doi:10/1056/NEJMc2100362

Оформити заявку на дослідження

Інші статті