Мікробіом кишківника, методом NGS, CYTO

Мікробіом кишечника – це сукупність усіх мікроорганізмів, які колонізують кишківник людини. Кишкова мікрофлора виконує численні важливі функції: сприяє травленню і всмоктуванню поживних речовин, підтримує метаболічні процеси, стимулює імунну систему, захищає організм від патогенів. Метод NGS (секвенування нового покоління) дозволяє визначити точний порядок нуклеотидів у молекулах ДНК мікроорганізмів. На основі послідовності певних генів (зокрема 16S рРНК) NGS може ідентифікувати наявні у зразку мікроорганізми до рівня роду і виду, а також встановити їх кількісне співвідношення.

Показання для призначення

1. Синдром подразненого кишечника та функціональні захворювання шлунково-кишкового тракту.
2. Запальні захворювання кишечника (хвороба Крона, виразковий коліт) – для діагностики та моніторингу лікування.
3. Тривалий прийом антибіотиків та підозра на дисбактеріоз кишечника.
4. Метаболічні порушення, ожиріння, проблеми з контролем ваги.
5. Алергічні реакції та харчова непереносимість.
6. Автоімунні захворювання та імунодефіцитні стани.
7. Хронічні захворювання печінки та жовчовивідних шляхів.
8. Неврологічні та психічні розлади (депресія, тривожні стани, розлади аутистичного спектру).

Клінічна значущість:

1. Визначення якісного та кількісного складу мікробіому кишечника для виявлення дисбіозу та розробки персоналізованої програми корекції мікрофлори.
2. Моніторинг ефективності пробіотичної терапії та дієтичних втручань при лікуванні захворювань, асоційованих з порушеннями мікробіоценозу.

Правила підготовки пацієнта:

За 3-4 дні до дослідження уникати прийому препаратів, що поси-люють перистальтику кишківника, або впливають на колір калу. Безпосередньо перед дефекацією не можна застосовувати проносні засоби, ректальні свічки, свічки касторової/вазелінової олії; клізми  та теплові процедури на живіт.

Обмеження:

За 1-2 дні виключити продукти з насінням;

Безпосередньо перед обстеженням не вживати алкоголь та продукти харчування, які посилюють бродіння в кишечнику; для уникнення впливу на результат, виключити прийом препаратів антигельмінтної, протипротозойної дії, пробіотиків тощо, якщо інше не вказано лікарем.

Якщо напередодні приймались антибіотики рекомендовано перенести здачу калу на 14 днів від останнього дня прийому антибіотиків.

Матеріал для дослідження зібрати з різних ділянок калових мас,  так як кількість мікроорганізмів та досліджуваної речовини може відрізнятись в різних частинах однієї порції біоматеріалу.

Для дітей, які на грудному вигодовуванні, правила прийому їжі та препаратів стосуються і мами немовляти.

Процедура відбору матеріалу

Використовують фекалії після природного акту дефекації, які збирають в чистий одноразовий контейнер за допомогою ложечки вгвинченої  в кришку контейнера. Попередньо перегляньте вміст стерильного контейнера на присутність в ньому паперового направлення. Контейнер має бути порожнім!!!

Збирають фекалії на чисту поверхню, в якості якої може бути використаний чистий новий лист паперу або одноразова ємність обдана окропом та просушена. При використанні ємності, її попередньо ретельно промивають з милом та губкою, ополіскують багатократно водопровідною водою, а потім обдають окропом та охолоджують. У немовлят проби фекалій забирають з підгузка.

Контейнер потрібно наповнити на одну третю. Біоматеріал потрібно брати з однієї порції калу з 7-10 різних місць ложечкою, вгвинчену  в кришку контейнеру. Контейнер закрити гвинтоподібними рухами.

Уникати під час збирання біологічного матеріалу в контейнер контакту з водою та сечею!

Контейнер забороняється закривати натисканням!!!

Закривати контейнер гвинтоподібними рухами!

Контейнер помістити в зіп-пакет.