Вагінальний мікробіом: навіщо секвенування нового покоління (NGS) і коли його призначати в гінекології

Піхва — це не стерильна порожнина. Це окрема мікробна екосистема, у якій у нормі переважають лактобактерії, а середовище залишається кислим. Коли цей баланс порушується, зростає ризик бактеріального вагінозу, рецидивної молочниці, аеробного вагініту, ускладнень вагітності та невдалих спроб запліднення.

Сучасна лабораторна діагностика дозволяє оцінити не окремі мікроорганізми, а весь вагінальний мікробіом. Для цього застосовують секвенування нового покоління — NGS. Метод показує, які мікроорганізми присутні, у якій кількості, а головне — які саме види лактобактерій захищають жінку і наскільки надійно.

Вагінальний мікробіом: чому він важливий для гінекології

Вагінальний мікробіом — це сукупність мікроорганізмів, які живуть у піхві, разом з їхнім генетичним матеріалом. У здорової жінки репродуктивного віку в ньому переважають лактобактерії: вони виробляють молочну кислоту, підтримують кислотність на рівні приблизно 3,8–4,5 і створюють середовище, у якому більшість збудників не може закріпитися.

Людина в цьому сенсі — біологічний виняток. З понад двадцяти досліджених видів ссавців лише у людини лактобактерії домінують у піхві: у нас їхня частка перевищує 70 %, тоді як у решти ссавців — менше одного відсотка, а кислотність значно нижча. Ймовірно, ця особливість сформувалася разом зі зміною харчування: термічна обробка крохмалю й перехід до зернових дали епітелію піхви стабільне джерело глікогену, а лактобактерії виявилися єдиними, хто вміє його ефективно використовувати.

Практичний висновок із цього простий: вагінальна ніша влаштована інакше, ніж кишкова чи ротова, і потребує власних методів оцінки. Підходи, що добре працюють для кишківника, тут дають неповну або хибну картину.

Вагінальний мікробіом, мікрофлора піхви і мікробіота: у чому різниця

У побуті найчастіше говорять «мікрофлора піхви». У медичних текстах усе частіше вживають слова «мікробіота» і «мікробіом».

Мікрофлора піхви — звичний термін для опису бактерій та інших мікроорганізмів у піхві.

Мікробіота піхви — спільнота мікроорганізмів, які там живуть, з урахуванням їхнього складу та співвідношення.

Вагінальний мікробіом — ширше поняття, яке охоплює не лише самі мікроорганізми, а і їхній генетичний матеріал. Саме його досліджують методом NGS.

Для лікаря різниця не термінологічна, а практична: аналіз мікробіому оцінює не окрему бактерію, а стан усієї системи — і саме це дозволяє зрозуміти, чому проблема повертається.

Чому мазка, посіву або стандартної ПЛР може бути недостатньо

У гінекологічній практиці традиційно використовують мікроскопію мазка, бактеріологічний посів і цільові ПЛР-панелі. Кожен метод корисний, але має межі.

Мікроскопія мазка оцінює загальну картину — співвідношення клітин, наявність «ключових клітин», лейкоцитів. Вона не показує, які саме види мікроорганізмів присутні.

Бактеріологічний посів виявляє лише те, що росте в лабораторних умовах. Значна частина бактерій, пов’язаних із бактеріальним вагінозом, є анаеробами й не культивується взагалі — у посіві їх просто немає.

Цільова ПЛР-панель шукає заздалегідь визначений перелік мікроорганізмів. Якщо збудника немає в переліку, метод його не побачить.

NGS працює інакше: він читає генетичний матеріал усіх бактерій у зразку одночасно і будує повний профіль спільноти.

Аналіз вагінального мікробіому методом NGS: що показує дослідження

Дослідження оцінює склад мікробної спільноти та співвідношення її учасників. Зокрема воно показує:

• які мікроорганізми присутні у зразку та в якій пропорції;
• які саме види лактобактерій переважають — це ключовий пункт, до якого повернемося нижче;
• тип мікробної спільноти за міжнародною класифікацією CST;
• чи є ознаки дисбіозу і наскільки вони виражені;
• чи виявляються маркерні мікроорганізми, характерні для бактеріального вагінозу або аеробного вагініту;
• рівень біорізноманіття — показник, який у піхві трактується протилежно до кишківника: висока різноманітність тут є ознакою порушення, а не здоров’я;
• як змінився мікробний профіль після лікування.

Результат не замінює гінекологічний огляд, мікроскопію та клінічну оцінку. Він дає лікарю додатковий рівень інформації там, де стандартних методів недостатньо.

Чому важливо розрізняти види лактобактерій

Це головна відмінність якісного NGS-дослідження від формального.

Звичайний звіт може показати «Lactobacillus — 96,8 %» і трактувати це як норму. Але за цією цифрою ховаються різні види з принципово різним прогнозом.

Lactobacillus crispatus — найнадійніший захисник. Виробляє D-молочну кислоту, перекис водню та бактеріоцини, формує найстабільніший стан спільноти з найнижчою частотою рецидивів.

Lactobacillus gasseri — захист є, але слабший; такий стан легше зсувається в бік дисбіозу під дією провокуючого чинника.

Lactobacillus iners — особливий випадок. Це лактобактерія з мінімальним геномом, яка виробляє лише слабшу L-молочну кислоту, не виробляє перекису водню і, на відміну від інших лактобактерій, синтезує інеролізин — токсин, що ушкоджує клітини власного епітелію. Вона першою заселяє нішу після епізоду вагінозу чи курсу антибіотиків, але до повноцінного відновлення не доводить.

Lactobacillus jensenii — захисний профіль, трапляється рідше.

Практичний наслідок: якщо дослідження не розрізняє види й повідомляє лише «лактобактерії в нормі», жінка з переважанням L. iners отримує висновок «усе добре» — і повертається з рецидивом через кілька місяців. Видова роздільна здатність тут не технічна деталь, а різниця між правильним і хибним прогнозом.

Типи мікробних спільнот CST: спільна мова для лікаря і лабораторії

Міжнародна класифікація поділяє вагінальні спільноти на п’ять типів. Це стандарт, яким користується світова література з 2011 року.

Класифікація дає лікарю не просто перелік бактерій, а зрозумілу характеристику стану: захищений, перехідний чи дисбіотичний — і дозволяє порівнювати результат із міжнародними даними.

Аналіз мікрофлори піхви: коли його призначають

Дослідження має сенс не як загальна перевірка для всіх, а тоді, коли лікарю потрібно ухвалити точніше рішення.

Рецидивний бактеріальний вагіноз

Найчастіше показання. Якщо вагіноз повертається після кожного курсу лікування, важливо зрозуміти, які саме мікроорганізми переважають і чи відновилися лактобактерії взагалі. Окремо оцінюються види, стійкі до стандартної терапії.

Рецидивна молочниця та незрозумілі виділення

Коли жінка роками лікує повторювані епізоди, а причина залишається незрозумілою, аналіз мікробіому допомагає побачити стан середовища, а не лише поточний симптом. Важливе застереження: метод 16S оцінює бактерії, тому гриби роду Candida ним надійно не визначаються — для них потрібне окреме дослідження.

Підготовка до допоміжних репродуктивних технологій

За опублікованими даними, стан вагінального мікробіому перед перенесенням ембріона пов’язаний з імовірністю живонародження: при переважанні L. crispatus вона найвища, при дисбіотичному типі спільноти — істотно нижча. Дослідження дозволяє оцінити середовище заздалегідь і за потреби скоригувати його до процедури.

Планування вагітності та ризик передчасних пологів

Дисбіотичний тип спільноти з певними маркерними бактеріями у другому триместрі пов’язаний з підвищеним ризиком передчасних пологів і запалення плодових оболонок. У наявних дослідженнях ця ознака виявилася інформативнішою за поєднання класичних клінічних чинників.

Персистенція вірусу папіломи людини

Стан мікробіому розглядають як супутній чинник перебігу папіломавірусної інфекції: захисний тип спільноти асоційований із самостійним очищенням від вірусу, дисбіотичний — із тривалою персистенцією.

Аеробний вагініт

Стан, при якому переважають не анаероби, а аеробні бактерії. Клінічно його часто плутають із вагінозом, хоча підходи до ведення відрізняються. NGS дозволяє розділити ці картини.

Контроль після лікування

Після курсу терапії важливо оцінити не лише зникнення симптомів, а й те, чи повернулися захисні лактобактерії і який саме вид зайняв нішу. Повторне дослідження зазвичай виконують через три місяці.

Коли дослідження не потрібне

Вагінальний мікробіом є у кожної жінки, але це не означає, що обстеження потрібне всім.

Аналіз зазвичай не показаний, якщо:

• немає скарг і клінічних ознак;
• лікар не бачить показань;
• пацієнтка хоче «просто перевірити всі бактерії» без клінічного запиту;
• дослідження планується під час менструації або одразу після лікування — результат буде неінформативним.

Результат має цінність тоді, коли його можна зіставити з оглядом, скаргами й планом ведення.

Підсумкова таблиця: коли аналіз вагінального мікробіому може бути корисним

Як правильно здавати матеріал

Якість результату значною мірою залежить від забору. Матеріалом є зішкріб із бічної стінки піхви; його виконує лікар або медична сестра.

Матеріал з різних ділянок не змішують: якщо потрібно оцінити кілька зон, зразки збирають окремо.

Підготовка до аналізу вагінального мікробіому

• Дослідження не проводять під час менструації; оптимально — у першій половині циклу після її завершення.
• За 4 тижні до аналізу завершити приймання антибіотиків — як системних, так і місцевих.
• За 2 тижні завершити приймання пробіотиків і вагінальних препаратів — свічок, кремів, гелів.
• За 48 годин утриматися від статевих контактів, спринцювань і використання тампонів.
• Не проводити дослідження одразу після ультразвукового обстеження вагінальним датчиком.
• У день забору не використовувати засоби інтимної гігієни, окрім чистої води.

Точні рекомендації щодо підготовки варто уточнити у лікаря або в лабораторії перед дослідженням.

Секвенування вагінального мікробіому в DIAGEN

Медична лабораторія DIAGEN виконує секвенування нового покоління вагінального мікробіому на платформі Illumina MiSeq з аналізом ділянок V3–V4 гена 16S рибосомальної РНК.

Принципова особливість: для вагінальної ніші ми розробили окремий порядок обробки даних, а не використовуємо універсальний. Це означає:

• визначення до виду, а не лише до роду — лікар бачить, яка саме лактобактерія переважає, і чи це захисний вид;
• класифікацію типу спільноти CST за міжнародним стандартом;
• окремий облік нішевих маркерів — мікроорганізмів, які мають значення саме у вагінальному середовищі й у загальних базах даних розпізнаються погано;
• розпізнавання клінічних патернів за доказовими критеріями Amsel, Nugent і Donders — як підказка лікарю, а не як діагноз;
• чотири ключові показники для швидкого огляду: рівень захисту лактобактерій, ознаки аеробного вагініту, ознаки вагінозу та біорізноманіття.

У звіті лікар отримує не довгий перелік бактерій, а структуровану картину: тип спільноти, ключові показники, розпізнані патерни з посиланням на критерії, таксономічний профіль і рекомендації щодо подальшої тактики.

Дослідження доступне у медичних центрах DIAGEN у Києві, Вишневому та Софіївській Борщагівці.

Питання та відповіді

Чим аналіз вагінального мікробіому відрізняється від звичайного мазка?

Мазок оцінює загальну картину під мікроскопом, посів показує лише те, що росте в лабораторії. NGS читає генетичний матеріал усіх бактерій у зразку й дає повний профіль спільноти з визначенням видів.

Чи може аналіз замінити огляд гінеколога?

Ні. Огляд, мікроскопія та клінічна оцінка залишаються основою діагностики. Аналіз мікробіому доповнює їх і відповідає на питання, на які інші методи відповіді не дають.

Чи покаже дослідження молочницю?

Метод 16S оцінює бактерії, тому гриби роду Candida ним надійно не визначаються. Якщо є підозра на кандидоз, потрібне окреме дослідження — про це прямо зазначено у звіті.

Чому в піхві високе біорізноманіття — це погано, а в кишківнику добре?

Це різні екосистеми. Здоровий кишківник багатий і різноманітний, здорова піхва — навпаки, з переважанням одного-двох захисних видів. Зростання різноманітності у піхві означає, що захист послабився.

Чи можна здати аналіз без направлення?

Так, але результат має інтерпретувати гінеколог. Без клінічного контексту його легко трактувати неправильно.

Скільки чекати результат?

NGS-дослідження готується довше за звичайну ПЛР або посів, оскільки включає секвенування та обробку даних. Орієнтовні терміни уточнюйте в лабораторії.

Висновок

Вагінальний мікробіом — окрема екосистема з власними правилами. Його стан впливає на перебіг бактеріального вагінозу, рецидивних виділень, на ризик ускладнень вагітності та на результат допоміжних репродуктивних технологій.

Аналіз методом NGS дозволяє побачити те, чого не показують мазок і посів: які саме види лактобактерій захищають жінку, до якого типу належить її мікробна спільнота і наскільки реальний ризик рецидиву. Особливе значення має видова роздільна здатність — без неї частина жінок отримує формально нормальний результат при фактично нестабільному стані середовища.

Лабораторний результат не є самостійним діагнозом. Його слід розглядати разом із клінічним оглядом, скаргами та рекомендаціями лікаря.

Джерела

1. Miller EA, Beasley DE, Dunn RR, Archie EA. Lactobacilli dominance and vaginal pH: why is the human vaginal microbiome unique? Front Microbiol. 2016;7:1936.
2. Ravel J, Gajer P, Abdo Z et al. Vaginal microbiome of reproductive-age women. Proc Natl Acad Sci USA. 2011;108(Suppl 1):4680–4687.
3. France MT, Ma B, Gajer P et al. VALENCIA: a nearest centroid classification method for vaginal microbial communities. Microbiome. 2020;8:166.
4. Petrova MI, Reid G, Vaneechoutte M, Lebeer S. Lactobacillus iners: friend or foe? Trends Microbiol. 2017;25(3):182–191.
5. Macklaim JM, Fernandes AD, Di Bella JM et al. Comparative meta-RNA-seq of the vaginal microbiota. Microbiome. 2013;1(1):12.
6. Vodstrcil LA, Plummer EL, Fairley CK et al. Male-partner treatment to prevent recurrence of bacterial vaginosis. N Engl J Med. 2025. DOI: 10.1056/NEJMoa2405404.
7. Koedooder R, Singer M, Schoenmakers S et al. The vaginal microbiome as a predictor for outcome of in vitro fertilization. Hum Reprod. 2019.
8. Mancabelli L, Tarracchini C, Milani C et al. Vaginal microbiota and reproductive outcomes. Microbiol Spectr. 2023.
9. Brown RG, Marchesi JR, Lee YS et al. Vaginal dysbiosis increases risk of preterm birth. BMC Med. 2018;16:9.
10. Fettweis JM, Serrano MG, Brooks JP et al. The vaginal microbiome and preterm birth. Nat Med. 2019;25:1012–1021.
11. Neidhöfer C et al. Vaginal microbiome and HPV persistence. Int J Mol Sci. 2025;26:1983.
12. Han M et al. Vaginal microbiota signatures in gynecological cancer screening. Open Life Sci. 2024.
13. Sommer F, Anderson JM, Bharti R et al. The resilience of the intestinal microbiota. Nat Rev Microbiol. 2017;15(10):630–638.
14. Gajer P, Brotman RM, Bai G et al. Temporal dynamics of the human vaginal microbiota. Sci Transl Med. 2012;4(132):132ra52.
15. Кремзер О.О., Крайдашенко О.В., Проць М.М. Мікробіом кишечника: основи діагностики для збереження здоров’я. Запорізький медичний журнал. 2025;27(2):173–179. DOI: 10.14739/2310-1210.2025.2.322064